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    minerva-biolabs常見(jiàn)問(wèn)題

    發(fā)布時(shí)間: 2022-12-07  點(diǎn)擊次數(shù): 453次

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    minerva-biolabs常見(jiàn)問(wèn)題與解答

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     Minerva-biolabs常見(jiàn)問(wèn)題

    蛋白酶K

    提供多少毫克蛋白酶?

    每小瓶蛋白酶K(目錄號(hào)56-0002)含有11 mg酶,約為30U/mg,再懸浮在550µl所含的再水合緩沖液中后,其濃度為20 mg/ml。

    你推薦什么樣的培養(yǎng)條件?DNA提取試劑(Venor®GeM樣品制備試劑盒)建議添加蛋白酶K,然后繼續(xù)提?。?/span>10分鐘,70°C溫育)。這難道不會(huì)給酶足夠的時(shí)間來(lái)工作并可能降解它嗎?

    在我們(廣泛)測(cè)試的方案中,蛋白酶K的孵育與樣品裂解同時(shí)進(jìn)行(您提到的步驟是在70°C10分鐘)。其想法是將裂解和蛋白酶K處理結(jié)合在一個(gè)步驟中,從而使方案盡可能短而有效。我們的數(shù)據(jù)(和質(zhì)量控制)表明,這種處理對(duì)相對(duì)復(fù)雜的基質(zhì)非常有效,表明在短的培養(yǎng)時(shí)間(和酶過(guò)量?。┫驴梢院雎宰冃?。例如,對(duì)于更復(fù)雜的基質(zhì)如組織,我們建議分離提取/裂解步驟和蛋白酶K處理,并在酶的最佳溫度50-56°C下進(jìn)行蛋白酶K處理。。

    我在用Venor®GeM樣品制備試劑盒分離支原體DNA時(shí)遇到問(wèn)題。由于樣品的特殊性質(zhì),有時(shí)會(huì)出現(xiàn)柱堵塞的問(wèn)題。有時(shí)樣品中出現(xiàn)白色薄片(可能是有機(jī)來(lái)源),離心后留在上清液中,從而堵塞柱。

    有時(shí)在含有較高蛋白質(zhì)量(例如疫苗、高血清濃度等)的樣品中觀察到柱堵塞。即使蛋白質(zhì)可能不是主要成分,它們也可能參與蛋白質(zhì)和其他成分之間復(fù)合物的形成。我們建議根據(jù)Venor®GeM樣品制備試劑盒手冊(cè)的說(shuō)明嘗試蛋白酶K處理(70°C培養(yǎng)步驟之前的可選步驟)。

    Venor®GeM樣品制備套件

    我在用Venor®GeM樣品制備試劑盒分離支原體DNA時(shí)遇到問(wèn)題。由于樣品的特殊性質(zhì),有時(shí)會(huì)出現(xiàn)柱堵塞的問(wèn)題。有時(shí)樣品中出現(xiàn)白色薄片(可能是有機(jī)來(lái)源),離心后留在上清液中,從而堵塞柱。

    有時(shí)在含有較高蛋白質(zhì)量(例如疫苗、高血清濃度等)的樣品中觀察到柱堵塞。即使蛋白質(zhì)可能不是主要成分,它們也可能參與蛋白質(zhì)和其他成分之間復(fù)合物的形成。我們建議根據(jù)Venor®GeM樣品制備試劑盒手冊(cè)的說(shuō)明嘗試蛋白酶K處理(70°C培養(yǎng)步驟之前的可選步驟)。

    我們將對(duì)EP合規(guī)性進(jìn)行支原體檢測(cè)。因此,我們計(jì)劃使用Venor®GeM樣品制備試劑盒從細(xì)胞上清液中提取支原體DNA。然而,我們需要將一些上清液冷凍在-20oC。你建議什么:從所有樣本中提取DNA并冷凍它們,或者在95oC下處理上清液(穩(wěn)定步驟)并冷凍它們?我們能把它們冷凍多久?

    我們強(qiáng)烈建議在取樣后直接加熱滅活樣品。如果你選擇冷凍,DNase在解凍階段會(huì)活躍,降解低拷貝數(shù)的支原體DNA。熱滅活后,您可以保存樣本,甚至可以在2-8°C的溫度下保存一周,并在室溫下無(wú)限制地處理它們。兩種版本都同樣有用:熱滅活或DNA提取,都是在采樣后立即進(jìn)行。

    對(duì)于這兩個(gè)版本,您可以將樣品儲(chǔ)存在<-18°C的溫度下至少1年。

    Venor®GeM產(chǎn)品線(xiàn)(用于常規(guī)PCR

    適用于所有Venor®GeM支原體檢測(cè)試劑盒

    該試劑盒可檢測(cè)到多少種支原體?

    基于引物基因組序列比對(duì),我們的試劑盒可以檢測(cè)到至少110種屬于軟體動(dòng)物綱的物種(瘦子、支原體、螺旋體、支原體),其中約165種是文獻(xiàn)中提到的物種。然而,對(duì)于許多不太常見(jiàn)的物種,沒(méi)有可靠的數(shù)據(jù)或序列信息。因此,我們不能對(duì)這些物種的試劑盒特異性做出任何聲明。

    重要的是,我們可以檢測(cè)出版物中提到的所有物種作為重要的細(xì)胞培養(yǎng)污染物和許多其他污染物。

    適用于所有Venor®GeM支原體檢測(cè)試劑盒

    內(nèi)部控制DNA(或內(nèi)部擴(kuò)增控制)的功能是什么?

    內(nèi)部控制表示在同一PCR反應(yīng)管中與靶擴(kuò)增(支原體)平行發(fā)生的第二擴(kuò)增反應(yīng)。內(nèi)部控制擴(kuò)增子的出現(xiàn)表明條件是PCR允許的(沒(méi)有PCR抑制)。因此,內(nèi)部控制DNA是一種有用的驗(yàn)證工具,有助于排除假陰性。

    Venor®GeM試劑盒中,內(nèi)部控制與目標(biāo)擴(kuò)增反應(yīng)的競(jìng)爭(zhēng)較弱。結(jié)果,目標(biāo)DNA的強(qiáng)擴(kuò)增(例如強(qiáng)污染)可能導(dǎo)致內(nèi)部控制擴(kuò)增失敗。因此,在嚴(yán)重污染的樣本或非常有效的PCR擴(kuò)增的情況下,缺失內(nèi)部控制是全正常的情況。因此,內(nèi)部控制的結(jié)果與陽(yáng)性PCR反應(yīng)無(wú)關(guān)。

    適用于所有Venor®GeM支原體檢測(cè)試劑盒

    我想在95°C下冷凍滅活步驟后的上清液,稍后再使用。在什么溫度下,我可以保存這些樣品多長(zhǎng)時(shí)間?

    根據(jù)我們的經(jīng)驗(yàn),樣品可以在-20°C下安全儲(chǔ)存至少1年。還可以將滅活上清液在RT下儲(chǔ)存5天或在+2-+8°C下儲(chǔ)存14天。

    適用于所有Venor®GeM支原體檢測(cè)試劑盒

    我們使用Venor®GeM qEP進(jìn)行的檢測(cè)一直效果良好。然而,這次陽(yáng)性對(duì)照失敗了。補(bǔ)液后,試劑盒按照方案中的建議正確儲(chǔ)存??赡艹隽耸裁磫?wèn)題?您有哪些建議可以確保陽(yáng)性對(duì)照的良好表現(xiàn)?

    陽(yáng)性對(duì)照作為一個(gè)小瓶提供。再水合后,只要您使用無(wú)DNase移液管端并在清潔的工作區(qū)域工作,該試劑在頻繁的解凍/冷凍循環(huán)中是穩(wěn)定的。

    然而,等分補(bǔ)充水分的陽(yáng)性對(duì)照可能會(huì)有所幫助。

    我們建議將其等分到PCR管中,因?yàn)樗鼈兺ǔJ歉蓛舻?、無(wú)DNase的和低結(jié)合性的。

    適用于所有Venor®GeM支原體檢測(cè)試劑盒

    在使用Venor®GeM支原體檢測(cè)試劑盒檢測(cè)支原體之前,請(qǐng)告訴我在沒(méi)有抗生素的情況下培養(yǎng)細(xì)胞48小時(shí)是否足夠?

    如果您的抗生素沒(méi)有顯示出對(duì)支原體的活性,則可以在沒(méi)有任何事先無(wú)抗生素培養(yǎng)的情況下進(jìn)行測(cè)試,并將提供有關(guān)支原體污染的可靠信息。

    在支原體活性抗生素的情況下,我們知道,在無(wú)抗生素培養(yǎng)的5天內(nèi),大多數(shù)支原體種類(lèi)的微小數(shù)量將增長(zhǎng)到易于檢測(cè)的水平。快速生長(zhǎng)的支原體種類(lèi)可能在48小時(shí)后可被檢測(cè)到??傊?,在沒(méi)有此類(lèi)抗生素的情況下,等待5天培養(yǎng)物生長(zhǎng)將給您帶來(lái)可靠的結(jié)果。請(qǐng)記住,PCR是最敏感的方法。使用其他技術(shù),您可能需要培養(yǎng)和延遲測(cè)試更長(zhǎng)時(shí)間。

    適用于所有Venor®GeM支原體檢測(cè)試劑盒

    Venor®GeM Classic手冊(cè)指出,在培養(yǎng)物中使用霉素和/或霉素不會(huì)影響測(cè)試。然而,我們使用的是抗生素抗真菌溶液,除了霉素和霉素外,還含有性霉素B。在進(jìn)行支原體測(cè)試之前,我們是否應(yīng)該在沒(méi)有抗生素抗真菌的情況下培養(yǎng)細(xì)胞?

    性霉素B對(duì)支原體沒(méi)有活性,不應(yīng)影響支原體檢測(cè)。

    補(bǔ)充抗生素抗真菌溶液的培養(yǎng)物可直接使用Venor®GeM Classic試劑盒進(jìn)行測(cè)試。

    適用于所有Venor®GeM支原體檢測(cè)試劑盒

    我們?cè)诿襟w上使用了大霉素,我想知道這是否會(huì)干擾測(cè)試。你指出霉素和霉素不會(huì)顯著改變測(cè)試的敏感性。大霉素會(huì)干擾嗎?

    盡管PCR檢測(cè)本身不會(huì)受到大霉素的影響,但支原體在樣本中生長(zhǎng)的能力顯然會(huì)受到影響。大霉素對(duì)支原體有活性,不幸的是導(dǎo)致耐藥菌株的發(fā)展很快。因此,如果可能,我們通常建議在培養(yǎng)1周后,在沒(méi)有抗生素添加劑的情況下測(cè)試培養(yǎng)物。

    適用于所有Venor®GeM支原體檢測(cè)試劑盒

    我們希望在解凍后直接用Venor®GeM Advance測(cè)試細(xì)胞(在液氮中冷凍保存),而無(wú)需事先培養(yǎng)。這可能嗎?

    用我們的PCR檢測(cè)方法(任何試劑盒)直接檢測(cè)解凍樣品或冷凍樣品通常是不可能的。原因是冷凍介質(zhì)中通常含有高濃度的FBSDMSO。這兩種物質(zhì)都抑制PCR反應(yīng)。對(duì)于這樣的樣品,PCRDNA提取是必要的。

    僅適用于Venor®GeM Classic

    我根據(jù)方案進(jìn)行的PCR沒(méi)有檢測(cè)到任何條帶(既沒(méi)有陽(yáng)性對(duì)照,也沒(méi)有內(nèi)部DNA對(duì)照)。

    試劑都是新鮮重懸的,沒(méi)有反復(fù)冷凍和解凍。我使用了熱啟動(dòng)Taq聚合酶,它在其他PCR反應(yīng)中表現(xiàn)良好。

    出了什么問(wèn)題?

    對(duì)于Venor®GeM Classic,我們建議使用熱啟動(dòng)DNA Taq聚合酶。

    使用在其他PCR設(shè)置中表現(xiàn)良好的聚合酶并不一定保證該特定PCR分析的成功。

    套件中提供的緩沖液對(duì)于底漆的正常工作至關(guān)重要。

    并非所有聚合酶在試劑盒緩沖液和條件下都表現(xiàn)良好。

    沒(méi)有擴(kuò)增通常表明酶與試劑盒不兼容。

    僅適用于Venor®GeM Classic、OneStepAdvance

    一些樣本顯示出感興趣基因(支原體)的強(qiáng)條帶,而內(nèi)部對(duì)照沒(méi)有條帶。我的樣本是否被污染或PCR運(yùn)行無(wú)效?

    只有陰性樣本才需要出現(xiàn)內(nèi)部控制帶。當(dāng)你的樣本被支原體嚴(yán)重污染時(shí),它的DNA會(huì)被成比例地?cái)U(kuò)增。在這些條件下,由于試劑競(jìng)爭(zhēng),內(nèi)部控制帶逐漸消失。因此,您可以得出結(jié)論,您的PCR運(yùn)行是有效的,不幸的是,您的樣本受到嚴(yán)重污染。

    僅適用于Venor®GeM Classic、OneStepAdvance

    如產(chǎn)品手冊(cè)所示,我們使用Venor®GeM ClassicMinerva BiolabsTaq聚合酶。我們無(wú)法檢測(cè)到陽(yáng)性或陰性控制通道中的任何頻帶(內(nèi)部控制未被放大)。原因可能是什么?

    -PCR反應(yīng)失敗的可能原因中,我們建議考慮使用中的PCR循環(huán)儀可能存在技術(shù)問(wèn)題的可能性。這不是一個(gè)遙遠(yuǎn)的可能性。為了評(píng)估循環(huán)儀的性能,我們建議測(cè)試具有相同PCR設(shè)置的另一個(gè)循環(huán)儀或具有相同循環(huán)儀的另一PCR設(shè)置。

    -陽(yáng)性對(duì)照DNA的再水合不正確(例如體積)

    -PC被正確地再水合,但進(jìn)行了太多的冷凍/解凍循環(huán),或由于DNase污染而發(fā)生DNA降解。

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