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ActiveMotif
產(chǎn)品時間:2020-04-12
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 ActiveMotif代理

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ATAC-Seq試劑盒

在全基因組范圍內(nèi)分析開放的染色質(zhì)區(qū)域。

ATAC-Seq試劑盒總覽

ATAC-Seq是一種快速檢測方法,可通過識別具有開放或可及狀態(tài)的染色質(zhì)區(qū)域來分析整個基因組的表觀遺傳概況。ATAC-Seq方法快速,簡便,適用于廣泛的樣品類型,已成為常用的表觀遺傳學(xué)分析方法,并且可以作為更深入的表觀遺傳學(xué)分析的基礎(chǔ)。

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ATAC-Seq實驗中,用高活性的突變Tn5轉(zhuǎn)座酶處理來自細胞或組織樣品的完整細胞核。該轉(zhuǎn)座酶把DNA片段化的同時用測序接頭標(biāo)記靶DNA。

Active MotifATAC-Seq試劑盒提供了與Illumina®平臺兼容的ATAC-Seq文庫制備試劑,可以從20 – 30 mg組織或50,000 – 100,000個細胞中生成16種不同的ATAC-Seq文庫。經(jīng)過優(yōu)化的方案將指導(dǎo)您完成樣品制備、DNA片段標(biāo)記和文庫構(gòu)建的步驟,構(gòu)建可在單個測序反應(yīng)中進行多重測序的文庫。

 

ATAC-Seq試劑盒亮點

顯示開放染色質(zhì)區(qū)域的基因組序列

僅需數(shù)小時即可完成NGS文庫制備

簡單,快速的實驗步驟與優(yōu)化的試劑

 

ATAC-Seq試劑盒數(shù)據(jù)

ATAC-Seq試劑盒包含進行16ATAC-Seq反應(yīng)所需的試劑和酶。這些試劑盒組分經(jīng)過優(yōu)化,可以高效工作,經(jīng)驗證可以生成高質(zhì)量的ATAC-Seq數(shù)據(jù)。

 

揭示啟動子處染色質(zhì)的開放位置

具有轉(zhuǎn)錄活性的基因,其啟動子處的染色質(zhì)通常是開放的或可及的。ATAC-Seq分析會在這些位置產(chǎn)生峰,揭示正在研究的樣品中開放的染色質(zhì)區(qū)域。

 

1ATAC-Seq試劑盒實驗結(jié)果展示在基因組瀏覽器中。ATAC-Seq試劑盒用于評估小鼠腦組織樣品的全基因組開放染色質(zhì)狀態(tài)。此處顯示的基因組瀏覽器軌跡位于FOXP3基因位置,該基因編碼有絲分裂后神經(jīng)元的生物標(biāo)記物。峰表明在FOXP3基因的啟動子上有開放的染色質(zhì)。

 

試劑盒實驗結(jié)果與已發(fā)表數(shù)據(jù)高度相關(guān)

Active MotifATAC-Seq試劑盒可生成高質(zhì)量數(shù)據(jù)。使用ATAC-Seq試劑盒產(chǎn)生的ATAC-Seq數(shù)據(jù)與已發(fā)表的ATAC-Seq數(shù)據(jù)具有很好的相關(guān)性,這突出說明了該檢測方法的可靠性和可重復(fù)性。

 

ATAC-Seq試劑盒組分

ATAC-Seq試劑盒包含兩盒組分,其中-20°C保存的一盒組分干冰運輸,4°C保存的另一盒組分室溫運輸。使用后,請根據(jù)說明書中的存放條件保存。妥善保管的試劑自收貨之日起可穩(wěn)定保存6個月。

 

試劑包括

 

ATAC Lysis Buffer, store at RT

Assembled Transposomes, store at -20°C

2X Tagmentation Buffer, store at -20°C

1X PBS, store at -20°C or RT

10X PBS, store at RT

10% Tween 20, store at RT

0.5% Digitonin, store at RT

DNA Purification Columns, store at RT

DNA Purification Binding Buffer, store at RT

DNA Purification Wash Buffer, store at RT

DNA Purification Elution Buffer, store at RT

3 M Sodium Acetate, store at RT

10 mM dNTPs, store at -20°C

5X Q5 Buffer, store at -20°C

Q5 High-Fidelity DNA Polymerase, store at -20°C

i7 Indexed Primer 1, store at -20°C

i7 Indexed Primer 2, store at -20°C

i7 Indexed Primer 3, store at -20°C

i7 Indexed Primer 4, store at -20°C

i5 Indexed Primer 1, store at -20°C

i5 Indexed Primer 2, store at -20°C

i5 Indexed Primer 3, store at -20°C

i5 Indexed Primer 4, store at -20°C

SPRI Beads, store at 4°C

 

單細胞ATAC-SeqscATAC-Seq)技術(shù)服務(wù)

單細胞水平識別染色質(zhì)開放區(qū)域一站式技術(shù)服務(wù)

scATAC-Seq 簡介

單細胞ATAC-SeqscATAC)基于轉(zhuǎn)座酶介導(dǎo)的測序引物插入開放的染色質(zhì)區(qū)域。像普通的ATAC-Seq一樣,該測定法提供了染色質(zhì)開放和可及區(qū)域的輪廓,這些輪廓指示了單細胞分辨率下的活躍調(diào)控區(qū)域。

 

我們的scATAC-Seq服務(wù)可以同時檢測數(shù)千個細胞的全基因組染色質(zhì)可及性,從而可以檢測異種群體中的細胞亞群,這種細胞亞群的信息會在普通ATAC-Seq中丟失。

 

了解更多關(guān)于ATAC-Seq的信息

 

使用scATAC-Seq有什么優(yōu)勢?

scATAC-Seq可用于鑒定復(fù)雜樣品中具有不同染色質(zhì)可及性譜的細胞亞群,從而無需諸如FACS或磁珠分選等分離策略,這些策略可能會由于樣品處理而改變細胞生物學(xué)特性。例如:

 

識別腫瘤樣本中的癌癥干細胞或浸潤性巨噬細胞

識別負責(zé)藥物治療反應(yīng)的新型細胞亞群(如:反應(yīng)者vs.耐藥細胞)

鑒定染色質(zhì)可及性變化的細胞亞群,可以洞察發(fā)育軌跡(如:大腦發(fā)育,輔助T細胞發(fā)育,B細胞分化)

 

 

北京華新康信生物科技有限公司代理ActiveMotif品牌。北京華新康信生物科技有限公司是 ActiveMotif品牌代理商。

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ActiveMotif

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組蛋白和組蛋白修飾抗體

用于檢測組蛋白和修飾組蛋白的抗體

由于組蛋白對基因組DNA的組織關(guān)重要,因此組蛋白的翻譯后修飾是基因組功能的重要調(diào)節(jié)劑。組蛋白修飾參與轉(zhuǎn)錄的調(diào)控,并在維持活性和非活性染色質(zhì)的離散區(qū)域中起作用。Active Motif正在為所有廣泛研究的和生物學(xué)相關(guān)的修飾位點開發(fā)一組抗體。我們嚴格篩選所有抗體的特異性,并進行測試以驗證它們在哪些應(yīng)用中效果良好,例如染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP),蛋白質(zhì)印跡和免疫熒光。

 

下表中的抗體針對組蛋白或修飾的組蛋白。單擊抗體名稱以查看其完整信息。要使用各種特定的搜索條件查找要尋找的抗體,請使用搜索框和/或在左欄中應(yīng)用各種過濾器。或者,您可以通過從右上角的可用產(chǎn)品下的列表中選擇,查看按不同組查看的抗體。

 

 

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