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PROTAC 介紹
PROTAC 全稱為 PROteolysis-TArgeting Chimeras (蛋白降解靶向嵌合分子),是一種雜合雙功能小分子化合物,結(jié)構(gòu)中含有兩種不同配體,一個(gè)是泛素連接酶 E3 配體,另一個(gè)是與細(xì)胞中目標(biāo)靶蛋白結(jié)合的配體,兩個(gè)配體之間通過(guò) linker 相連,從而形成 “ 三體 " 聚合物——靶蛋白配體-Linker-E3 配體。
PROTAC 分子在進(jìn)入細(xì)胞后,其結(jié)構(gòu)中的目標(biāo)蛋白(Protein of Interest, POI)配體可特異性地與相應(yīng)的靶蛋白結(jié)合,而另一端可以募集 E3 連接酶從而形成 POI-Linker-E3 ligase 三元復(fù)合物,其中 E3 連接酶可介導(dǎo)泛素結(jié)合酶 E2 對(duì) POI 泛素化。被泛素標(biāo)記的 POI 被蛋白酶體識(shí)別并降解。此過(guò)程無(wú)需靶蛋白配體長(zhǎng)時(shí)間占據(jù)結(jié)合位點(diǎn),只需三元復(fù)合物短暫的形成便可瞬時(shí)完成目標(biāo)蛋白的泛素化,并且 PROTAC 在細(xì)胞內(nèi)可多次循環(huán)利用。
PROTAC 分子一般由三部分組成:靶蛋白配體、連接子 Linker 以及 E3 蛋白連接酶配體。
E3 連接酶配體的選擇(Ligand for E3 Ligase)
E3 連接酶是引起靶蛋白泛素化的關(guān)鍵結(jié)構(gòu),它的配體包括諸多種類,CRBN (Cereblon)、VHL (von Hippel-Lindau)、IAP 及 MDM2 等為目前常見類別。在選擇上一般優(yōu)先挑選類藥性更好的 CRBN 度胺類配體,其次是 VHL 及 IAP 等由內(nèi)源性配體肽段的衍生結(jié)構(gòu)。最后也需考慮具體的靶標(biāo)蛋白所在細(xì)胞中相應(yīng) E3 連接酶的豐度以及最終 PROTAC 的理化性質(zhì)參數(shù)。
連接子 Linker 的選擇(PROTAC Linker)
連接子是連接 E3 連接酶配體和靶蛋白配體的化學(xué)分子。連接子的性質(zhì)對(duì) PROTAC 的細(xì)胞膜通透性、藥效和代謝分布均有很大的影響。理想的連接子長(zhǎng)度應(yīng)能在空間上既不影響兩個(gè)蛋白結(jié)合又能維持它們低的結(jié)合熵。目前還有將連接子改造成多接頭、光轉(zhuǎn)換接頭的研究。
靶蛋白配體的選擇(Ligand for Target Protein for PROTAC)
靶蛋白配體作為 PROTAC 的導(dǎo)向基團(tuán),負(fù)責(zé)對(duì)靶蛋白的捕獲,因而需要有較高的配位能力與選擇性。在實(shí)際應(yīng)用中,蛋白質(zhì)已有的抑制劑與激動(dòng)劑均可以作為配體候選,而無(wú)相關(guān)分子報(bào)道的蛋白則可采用高通量篩選與虛擬篩選等方式尋找配體,并不要求配體與蛋白是抑制性或競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合,但需對(duì)靶蛋白具有較高專一性。
代謝組學(xué)分析檢測(cè)服務(wù)
代謝組學(xué)(Metabolomics)是繼基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)后出現(xiàn)的新興組學(xué),通過(guò)考察生物體系在某一特定時(shí)期內(nèi)受到刺激或擾動(dòng)前后所有小分子代謝物的組成及含量變化,尋找代謝物與生理病理變化的相對(duì)關(guān)系。主要研究對(duì)象為分子量 1,500 Da 以內(nèi)的小分子物質(zhì)。
MCE 代謝組學(xué)分析檢測(cè)服務(wù)主要包括非靶向代謝組學(xué)(untargeted metabolomics)和靶向代謝組學(xué)(targeted metabolomics)兩大類。
非靶向代謝組學(xué) 靶向代謝組學(xué)
描述
分類
實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>
服務(wù)內(nèi)容
交付內(nèi)容
系統(tǒng)全面分析樣本整個(gè)代謝組,比較生物體受到刺激后所有小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化,結(jié)合生物信息學(xué)分析找到差異代謝物,對(duì)差異代謝物進(jìn)行通路分析,揭示其與生理病理變化的相關(guān)性
針對(duì)某一物質(zhì)或某一類代謝物,以標(biāo)準(zhǔn)品為參照,對(duì)目標(biāo)代謝物在生物樣本中的絕對(duì)濃度進(jìn)行定量檢測(cè),特異性強(qiáng)、靈敏度高、定量準(zhǔn)確
LC-MS
非靶向代謝
組學(xué)
GC-MS
非靶向代謝
組學(xué)
脂質(zhì)組學(xué)
氨基酸、短鏈脂肪酸、游離脂肪酸、植物激素等
發(fā)現(xiàn)差異:
不同樣品組之間尋找差異代謝物;相對(duì)定量
驗(yàn)證差異:
特異性關(guān)注某一或某一類代謝物;絕對(duì)定量
激酶譜篩選
激酶廣泛參與細(xì)胞周期、信號(hào)傳導(dǎo)、蛋白調(diào)控等重要生理過(guò)程,是細(xì)胞功能的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,是生物體內(nèi)最大且功能最多樣的基因家族之一。激酶功能的失調(diào)與許多疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),是重要的藥物靶標(biāo)。然而激酶家族蛋白結(jié)構(gòu)(特別是催化域)的高度保守性,給高效選擇性激酶抑制劑的開發(fā)帶來(lái)了巨大挑戰(zhàn)。常規(guī)大規(guī)模選擇性分析已成為新激酶抑制劑設(shè)計(jì)的要求。
MCE 能夠提供優(yōu)質(zhì)全面的激酶譜篩選,獲得化合物與激酶結(jié)合親和力 / 活性差異的數(shù)據(jù),用以評(píng)價(jià)化合物的靶標(biāo)選擇性。
我們的優(yōu)勢(shì)
激酶種類多
400+ 激酶,包含 AGC、CAMK、CMGC、CK1、
STE、TK、TKL 等激酶家族及常見突變體
定制激酶譜
特色 TK、CDK 激酶譜,60 / 207 / 302
激酶譜及多種定制激酶譜可選
檢測(cè)方法多樣
TR-FRET (LANCE Ultra, LathaScreen, HTRF) ,熒光法 (Kinase-Glo, ADP-Glo), Z`-LYTE, Binding assay 等
檢測(cè)周期短
化合物檢測(cè)出報(bào)告周期最短 3-5 個(gè)工作日,1-2 個(gè)
工作日可提交數(shù)據(jù)
精準(zhǔn)篩選
對(duì)于已有明確特異抑制劑的激酶選用其特異性抑制劑建立實(shí)驗(yàn)?zāi)P?,控?span> IC50 差異與文獻(xiàn)報(bào)道值在 5 倍以內(nèi),最大不超過(guò) 7 倍
離子通道篩選服務(wù)
離子通道是一類跨膜的大分子孔道,可允許離子在電化學(xué)梯度驅(qū)動(dòng)下穿過(guò)細(xì)胞膜,從而完成信號(hào)傳導(dǎo)、細(xì)胞興奮性調(diào)節(jié)等生理功能。 離子通道功能及表達(dá)異常可導(dǎo)致多種疾病,迄今已發(fā)現(xiàn)60多種疾病與編碼離子通道的基因相關(guān)。離子通道已成為當(dāng)前藥物研發(fā)中僅次于G蛋白偶聯(lián)受體、 蛋白激酶的第三大類藥物靶點(diǎn)。此外,離子通道在評(píng)估藥物安全性方面也至關(guān)重要。hERG (Kv11.1)編碼的鉀通道介導(dǎo)一種延遲整流鉀電流 (IKr),IKr抑制是藥物導(dǎo)致QT間期延長(zhǎng)最重要的機(jī)制。
篩選流程
電生理膜片鉗技術(shù) (Patch Clamp Technique)是檢測(cè)化合物對(duì)離子通道作用的金標(biāo)準(zhǔn)。高通量鑒定化合物的離子通道效能、特異性或脫靶可能性是早期藥物發(fā)現(xiàn)中的關(guān)鍵步驟。MCE離子通道篩選平臺(tái)同時(shí)具有手動(dòng)膜片鉗系統(tǒng)及高通量自動(dòng)化膜片鉗系統(tǒng) (Sophion Qpatch, IonWorks Barracuda)、基于熒光的高通量離子通道檢測(cè)系統(tǒng),可以提供形式多樣的高表達(dá)細(xì)胞系、神經(jīng)元的離子通道檢測(cè)及新藥臨床前離子通道作用評(píng)價(jià)服務(wù)。
服務(wù)優(yōu)勢(shì)
不同通量篩選平臺(tái)滿足不同需求:Qpatch 16X、Qpatch HTX、IonWorks Barracuda、FDSS/μCell及手動(dòng)膜片鉗
手動(dòng)膜片鉗平臺(tái):離子通道檢測(cè)金標(biāo)準(zhǔn),經(jīng)驗(yàn)豐富的專業(yè)人員操作
一站式服務(wù):600萬(wàn)+現(xiàn)貨化合物
離子通道類型多樣:氯通道、鈉通道、鉀通道、鈣通道、TRP通道等
離子通道細(xì)胞系定制服務(wù)
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其他的這些是菌株
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